近年來投資國內外金融商品風氣盛行，營利事業投資國內上市（櫃）、未上市（櫃）股票及國內基金之證券交易所得，雖停徵營利事業所得稅，惟應計入基本所得額。
財政部高雄國稅局說明，所得稅法第4條之1規定證券交易所得，停止課徵所得稅。至本條文之適用範圍，以我國證券交易稅條例所稱有價證券為限。依此，營利事業處分國內基金所發生之利得，屬證券交易所得，為所得稅法第4條之1規定停徵所得稅之範圍，免徵營利事業所得稅，惟該證券交易所得，應依所得基本稅額條例（下稱本條例）第7條第1項規定，納入營利事業之基本所得額計算基本稅額。
該局舉例說明，轄內甲公司110年度透過A銀行申購國內基金，並於112年度申請贖回，113年初接獲A銀行寄發112年度所得資料明細通知單，載有甲公司112年度處分國內基金利得新臺幣（下同）200萬元，而甲公司112年度營利事業所得稅結算申報課稅所得額為70萬元，甲公司以該處分利得屬所得稅法第4條之1規定停徵所得稅之證券交易所得，免徵營利事業所得稅，致漏未揭露，亦未計入營利事業之基本所得額申報，經該局查獲短漏報基本所得額200萬元，除就基本稅額25萬2千元｛〔（200萬元＋70萬元）–本條例第8條規定得扣除金額60萬元〕×12%＝25.2萬元｝與一般所得稅額14萬元（70萬元×20%＝14萬元）之差額，核定補徵基本稅額11萬2千元（25.2萬元–14萬元＝11.2萬元）外，並依本條例第15條規定予以處罰。
該局呼籲營利事業自行檢視基本所得額，如有未加計停徵所得稅之證券交易所得者，凡屬未經檢舉、未經稅捐稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，請儘速依稅捐稽徵法第48條之1規定自動辦理更正申報並補繳所漏稅款及加計利息，以免疏忽遭補稅及處罰。營利事業如有任何疑問，可撥打免費服務電話0800-000321洽詢，或至該局網站（https://www.ntbk.gov.tw）利用國稅智慧客服「國稅小幫手」線上查詢。
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