財政部北區國稅局表示，公司組織之營利事業如欲適用所得稅法第39條盈虧互抵之規定，除須會計帳冊簿據完備、虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證外，並應「如期申報」。財政部近期發布解釋令，放寬營利事業適用盈虧互抵之「如期申報」要件，倘營利事業逾期繳納所得稅申報應自行繳納之應納稅額，惟未符合稅捐稽徵法第20條第1項應加徵滯納金規定者，得視為情節輕微，仍符合「如期申報」要件可適用盈虧互抵。
該局舉例說明，甲公司112年度會計帳冊簿據完備，經會計師查核簽證申報全年所得額新臺幣（下同）1,000萬元，列報前10年虧損扣除500萬元，課稅所得額500萬元，應納稅額100萬元，甲公司於113年5月31日（星期五）辦理結算申報，惟遲至113年6月3日（星期一）始繳納自繳稅額，依據稅捐稽徵法第20條第1項規定，逾期繳納稅捐每逾3日按滯納數額加徵1％滯納金，甲公司雖逾期繳納自繳稅額，但尚未符合加徵滯納金之規定，依據財政部新頒解釋令，仍可適用盈虧互抵500萬元。
該局提醒，營利事業如逾期繳納自繳稅額已逾法定期限3日以上者，不符合「如期申報」要件，將無法適用盈虧互抵規定。如仍有不明瞭之處，可至該局網站（https://www.ntbna.gov.tw）查詢相關法令或利用免費服務電話0800-000321洽詢，該局將竭誠提供詳細之諮詢服務。
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