納稅義務人對於核定稅捐之處分如有不服，得依稅捐稽徵法第35條規定於繳納期間屆滿翌日起算30日內申請復查，惟若申請主體不符合法定當事人資格者，稅捐稽徵機關復查決定會以程序不合駁回。
南區國稅局表示，公司組織之營利事業，具有法律上獨立人格，與代表法人之自然人為各別的權利義務主體，這與一般獨資組織營利事業對外雖以所經營之商號名義營業，實際上仍屬個人之事業，係以該獨資經營之自然人為權利義務之主體，有所不同。該局於受理復查案件中常發現，公司組織以代表人個人名義申請復查，致不符合法定當事人資格。因此，該局特別說明，公司法人欲行使法律上權利，應依稅捐稽徵法施行細則第11條第2項第1款規定，以公司名義申請始為適法。
該局又說，依照公司法成立之公司，因合併有變更公司名稱及其他法定登記事項，依稅捐稽徵法第15條規定，應由合併後存續或另立之營利事業負繳納稅款之義務，故申請復查主體應是合併後存續或另立之營利事業始有當事人資格，如逕以代表人個人名義或以合併後消滅公司之名稱申請復查，又未能補正者，稅捐稽徵機關會以當事人主體不適格，依程序不合、實體不究之法理，決定駁回復查。
該局指出，臺灣產業結構以中小企業偏多，且多為家族企業，致常發生公司法人及其代表人個人權利義務或身分混淆之情事，該局特別提醒營利事業，於申請復查時，除應注意法定申請期限外，亦須留心當事人資格之規定，以免影響自身行政救濟權益。
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