財政部南區國稅局表示，納稅義務人經營之獨資商號若於年度中變更為合夥，應依所得稅法第14條第1項第1類規定，以合夥事實發生日為基準，分別計算獨資及合夥期間應歸屬之營利所得，申報綜合所得稅。
該局舉例說明，轄內納稅義務人甲君原獨資經營A工程行，嗣於103年12月22日轉讓其出資額50%於乙君，並向地方政府申請變更組織為合夥，於辦理103年度綜合所得稅結算申報時，列報按合夥比例50%計算之營利所得，經該局查獲，乃按該商號103年度全年所得額核定數200萬元，依合夥事實發生日（即103年12月22日）分別據以核算甲君獨資及合夥期間之營利所得為1,945,205元（2,000,000元×355天∕365天）及27,397元（2,000,000元×10天∕365天×50%），合計1,972,602元，併課甲君當年度綜合所得稅，除補徵稅額外，並按所漏稅額裁處0.2倍罰鍰。甲君不服，主張由獨資變更為合夥組織，毋須辦理清決算，應按年底之出資比例核課營利所得。該局以本件依合夥契約書所載，除出資額之轉讓外，並無其他約定事項，自應按不同組織型態應實際歸屬所得人之方式核課營利所得。案經復查及訴願均遭駁回而告確定。
該局進一步說明，綜合所得稅係採自行申報制，有所得即應申報，甲君倘就前開營利所得之申報有疑義時，於申報前，自應向稅捐稽徵機關查詢，於獲得正確及充分之資訊後，再以A工程行申報103年度營利事業所得稅之所得額，按甲君獨資及合夥期間分別計算其營利所得，尚不得以認知差異為由，卸免其誠實申報納稅之義務。
該局提醒民眾，若於結算申報期後發現有短漏報情事，在未經檢舉或未經稽徵機關進行調查前，請儘速辦理自動補報補繳，以免遭查獲受罰。如尚有疑義，可直接向就近之國稅局洽詢，或於上班時間撥打免費服務電話0800－000321，將有專人為您詳細解說。
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