財政部臺北國稅局表示，營利事業因轉投資之事業減資彌補虧損、合併、破產或清算等產生投資損失，在辦理營利事業所得稅申報時，除須注意投資損失應以實現者才能申報外，尚須以歷次減資彌補虧損後之投資成本餘額計算出資額折減金額，以免重複列報投資損失。
該局指出，依營利事業所得稅查核準則第99條第1款規定，投資損失應以實現者為限；其被投資之事業發生虧損，而原出資額並未折減者，不予認定。此外，營利事業投資損失如屬被投資事業清算所產生者，應以原始投資成本減除清算後實際分配金額計算投資損失，倘在清算前已因被投資公司減資彌補虧損而列報過的投資損失，清算時應自原始投資成本中減除。
該局舉例說明，甲公司在100年間投資乙公司，原始投資成本為新臺幣（下同）1,200萬元，乙公司因經營不善連年虧損，因此在105年辦理減資彌補虧損，甲公司於105年依原始投資成本按減資比例列報投資損失900萬元，減資後甲公司對乙公司的投資成本餘額應為300萬元；經過多年營運，乙公司業務仍未見起色，遂於108年結束營業辦理清算，甲公司取得清算分配款30萬元，甲公司投資損失應為270萬元（原始投資成本1,200萬元-105年列報之投資損失900萬元-清算分配款30萬元），惟甲公司卻仍以原始投資成本1,200萬元列報投資損失1,170萬元（原始投資成本1,200萬元－清算分配款30萬元），致重複列報投資損失900萬元，經核定補徵稅額180萬元並裁處罰鍰。
該局提醒，營利事業在列報投資損失時，除應符合營利事業所得稅查核準則第99條規定外，並應檢視對被投資公司投資成本變動情形，以免發生重複列報投資損失而遭補稅處罰。
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